"矩阵"于魏启历1167年在极北荒原北部海边洞穴中被发现, 那时的文明水平尚不足以解析矩阵的秘密。
魏启历1731年, “矩阵研究院”作为一个普通的研究组织成立，当时，人们对矩阵的尚且理解停留在神秘学、占星术层面，学者们发现了矩阵自旋周期与辉光天象之间的某种联系，除此之外无任何进展。
魏启历1921年，可巧，矩阵研究室的研究员们通过稿纸和钢笔手动记录，从矩阵生成的传递场[1]中解读出标志[2]的序列化表示，这个发现将科学、文明与宗教联系在了一起，让矩阵更加神秘。通过相同方法，对接近魏启历元年的古籍、第一批可达尔移民遗物的研究，科学家们发现了从矩阵中单向读取信息的方法。
研究室成员一致人为这是某种充满了“信息”的古遗物，鉴于矩阵太过反常理的性能与形态，这些信息很可能是至关重要的。当时，世界局势日益紧张，研究室选择将这一发现优先告知政府，并未对外界宣扬，只表明“可能初步解析了矩阵的运行原理”。
魏启历1922年，研究室已经厌倦了通过草稿纸与钢笔记录矩阵输出的各种无法解码的信息，相信简单暴力的方法会更加有效。来自铁桶帝国的科学家们准备使用气割热刀切开矩阵，看看里面有什么东西。但最终，气割枪离开矩阵外壳时，没能留下一点伤痕。后来，研究室还尝试过化学腐蚀、电极、使用强磁场和应力场对外壳施加影响、甚至用武器射击的方法，无一成功。研究室认为这是一种“难以理解且机械性能强硬，化学性质难以想象地懒惰的物质外壳。”
魏启历1924年春，矩阵的研究终于迎来了第一次突破，一位年轻、名不见经传的研究员——伊佐诺——似乎破解了一个数学游戏，他从上十张写满数字的草稿纸上看出了某种规律，几经尝试，发现如果使用纵横交错的线条表示谐振场在不同时刻的状态，然后对线条的转折、交点等位置进行类似文字游戏的编码和转化，找到了一种将传递场信号解码为古北大陆文的“规律”，而解码后的古北大陆文“恰好”能够被通顺地阅读。
“矩阵”一直在说话。
这本是光耀古今的巨大发现，即将发表的论文与“来自矩阵的信息”原文却被刚刚登台的新元首蒙大拿的突然来访给打断了。
蒙大拿命令矩阵研究室不可向外界发表任何信息，并第一时间将所有发现上交帝国政府，同时提供了资金支持。原因是：直觉。
是年夏，矩阵的研究迎来了一个又一个可喜可贺的突破，研究员们先是发现矩阵一直使用伊佐诺发现的简单“规律”，“说”着某些稍稍复杂“规律”的定义，然后复用这些稍稍复杂的“规律”表达新的、更加复杂的“规律”，如此往复，“规律”越来越紧凑，一代更比一代复杂，矩阵似乎在和他们玩一个奇妙的逻辑游戏。伊佐诺居然对这种“游戏”情有独钟，一个月后，他的办公桌上遍布着纵横的线条纸张，成为了研究组长，同时，用最后“规律”表示的文本的意义也被解释：
“寻找安全的地点。”
这是一条没来由的指令，矩阵研究室将发现上报，没想到却得到元首的亲笔函作为回应：“矩阵现在收归军队所有，转移到极北荒原的6号军事驻地。”研究员们压根没想过要在军事基地里继续矩阵的研究，其中一些没有意愿的研究员离开了研究组，另一些热爱矩阵研究的成员则随矩阵迁往6号军事驻地。
秋，装载有矩阵的轮船在辉光的照耀之下停泊在光学港，吊车在军队的护送中把矩阵运往6号军事驻地。研究员们很快发现这里的安保更加严密——严密到让人不适，期间，又有部分研究员或是耐不住军事基地的环境，或是对那些虎视眈眈的站岗士兵和悬空的神秘矩阵产生了某种不祥的预感，离开了矩阵研究。也有研究员在离开前警告伊佐诺：“矩阵”可能比我们想象的更加复杂，他或许拥有智慧，或许拥有意识，盲目地相信一个来路不明、我们无法理解的神秘个体可能酿成灾难。
管理者们表示这是元首的指令，没人理会，伊佐诺也当然不会听。
是年九月，仍然留在矩阵身边的研究员们收到了一张保密协定——实际上，签署协定的研究员只有三十七人，而那时还留在矩阵身边的狂热的研究员也只剩下三十七人。
伊佐诺与矩阵的游戏仍然没有结束，他桌上交错的线条越来越复杂，矩阵“说话”的内容也不断变化。花（Mono）是矩阵的第一句话，伊佐诺用一些简单的猜想看出了矩阵对话语编码的规律。他将矩阵的语言称为“莫诺密码”，时至今日，矩阵不断使用旧的莫诺密码规则陈述着新的密码规则，莫诺密码已经复杂到了难以置信的地步，有时，一句话，伊佐诺就需要一整天的时间去推演、解码。为了加快速度，参与研究的数名机械工程学家们造出了简陋的“莫诺密码机”原型。
冬天，帝国宣布解散了“矩阵研究室”，沉溺于与矩阵斗智斗勇的研究员们当然什么都不会关心。
魏启历1929年，矩阵“说话”的内容似乎从不断迭代更新变为不断重复，伊佐诺破解了最后的密码符号，莫诺密码体系至此终于稳定，矩阵再无任何变化，研究员们找不到任何突破口，过了三个月，矩阵仍然没有放送新的信息。
但他们并不沮丧，毕竟，破解密码的过程是这些疯子最为享受的内容。十一月的一个正午，所有的研究员们在一起吃午饭，用北方粗陋的甜根草酒充当佳酿，庆祝研究的失败。
矮壮的普罗是一位数学家，他正咀嚼着土豆，开玩笑说：“我们的研究结果如果除开咖啡的十三种烹饪方法，可能就只剩下这套无比复杂的莫诺密码了。”
有人发表意见：“我觉得这并不只是一种‘密码’，它可能是一种非常优秀的‘语言’，你没发现莫诺密码的信息密度比我们现存的任意一门语言都高出至少一个数量级吗？”
“搞不懂那个胖胖的元首为什么会支持我们继续研究，不过我倒是不反对，我喜欢破译那些语言”
另一个研究员指正：“这种工作并不能算‘破译’语言，而是‘建构’，矩阵在从易到难地指导我们‘建构’一套语言体系。而今天的‘莫诺密码’——它根本没法破译！”
普罗补充，“虽然厉害，但没人有能力用这么复杂的语言。它就像一个厉害的数学教授——如果矩阵真的拥有‘意识’——教授我们高深且一无是处的知识。唉，话说你们真的相信矩阵拥有...”
“或许帝国正需要这种语言密码！”，另一个醉醺醺的研究员打断普罗，“呵呵，可惜，这套密码世界上仅存的唯一一台解码机——我们露天放置的那个巨无霸，叫做‘呆瓜’的鬼东西——经过无数校正依然错误频发，编码方式除了手算以外别无他法...”
这很明显引起了机械工程师的不满，“嘿，‘呆瓜’可没你说的那么差劲，它还能自动监听矩阵的信息，如果没出错——还能自动向外面吐字条”
“‘呆瓜’吐字条了！”，伊佐诺突然推门而入，地下餐厅里安静下来，所有目光聚焦在伊佐诺身上，他乱糟糟的头发披在他的肩膀上：“难以置信！”
“它说什么？”，恰然一个拿着面包往嘴里塞的研究员问伊佐诺。伊佐诺说：“它让我绕着它逆时针转匀速连续17.7圈，然后触摸它的底角。”，他激动地挥舞双臂：“你们难道不觉得这是启动某些东西的仪式吗？”
“额嗯...”。餐厅再次安静，普罗看着开心但精神似乎不太正常的伊佐诺，探问：“...这，对...正是如此，因为我们不知道我们要启动什么玩意儿，所以得慎重考虑。”
“又是一条神秘的命令”，一个研究员发表看法：“但我已经见怪不怪了，得先向上面报告...”
报告什么，我已经摸过了！伊佐诺喊，他兴奋得像一个刚刚挖到泥鳅的小孩，这让普罗一下子吞掉了半个土豆，“它‘打开’了！还给了我这个！”，不待众人反应，他从大衣里面不知道什么地方掏出一个闪着蓝色光路、拳头大小的深黑机械造物：“诺，就是这个...”
餐厅炸了锅，研究员们从各自的座位上弹起，有人不小心撞到了低矮的天花板，有人踩到了椅子角，仰面摔倒在地，“等等！等等！”，普罗比划着退后：“那个方方的家伙是**怎么‘给’你这****的玩意的？”
“它‘打开’了呀！” “你**说打开，它是**怎么能‘打开’啊！”
“它自己‘打开’了”，伊佐诺似乎对研究员们惊恐的表情感到不解：“嗡嗡地叫，如果非得描述——可能，像一只‘八爪鱼’一样‘打开’？”
普罗还没能回答，地下餐厅的大门再次被撞开，跑进来两名全副武装的卫兵：“天哪...先生们，快上地面，你们得看看！”
研究员们急匆匆地踏着迈向地面的台阶，而地面之上正刮着暴风雪，‘呆瓜’劈里啪啦地吐着一串串崭新的字条，天穹之上，美丽的辉光——这些数千年来无法解释的奇异天象——正虹吸一般涌入地表。